Marek Schwarz se narodil v Mladé Boleslavi, avšak do velkého hokeje nakoukl ve Spartě. V roce 2003 si zde teprve jako šestnáctiletý připsal extraligovou premiéru. Po draftu týmem St. Louis Blues následovalo angažmá ve WHL v týmu Vancouver Giants, ale po roce se Schwarz vrátil zpět do Prahy.

Ani v Česku se však příliš dlouho neohřál a v roce 2006 odešel znovu do zámoří. Dočkal se zde kýženého startu v NHL. Za St. Louis Blues nastoupil do branky ve čtyřech zápasech. V roce 2009 podepsal smlouvu s Mladou Boleslaví. Sezónu 2011/2012 strávil ve finském Turku. Posléze se usadil v Liberci. S Bílými Tygry oslavil v ročníku 2015/2016 extraligový titul.

Následně zamířil za novou výzvou do mezinárodní EBEL. Ligu i Znojmo si oblíbil. "Hrozně se mi tady líbí. Mám rád historii a Znojmo je historické město," pochvaloval si v jednom z rozhovorů.

Marek Schwarz od svých 17 let pravidelně oblékal i dres mládežnických reprezentačních výběrů, kde posbíral mnoho individuálních ocenění z vrcholných akcí. V roce 2009 se prosadil také v seniorské reprezentaci. Na svém kontě má 5 reprezentačních startů.